運輸活蛇的容器具有蛇籠、蛇箱、蛇簍、蛇袋等，這些器具各有利弊，如蛇袋攜帶方便，但只能裝少量的，對長途運輸不適用；蛇籠系鐵絲製成，透風，用水沖洗方便，但疊高了容易變形；蛇簍系竹片製成，輕便而且成本低，但易破，容量也不大；蛇箱系木板製成，可疊壓堆高，但通氣效能差。究竟採用哪種容器裝載比較合適，首先根據路途遠近和裝載數量，其次根據蛇的用途决定。如果是種蛇，較好包裝兩層，先將種蛇裝入蛇袋，紮緊袋口，再把蛇袋懸掛於蛇籠或蛇箱中運輸，這樣可减少震盪和碰撞，使種蛇不受傷。如果是菜蛇，可直接將蛇裝人蛇籠或蛇箱中，縛緊籠蓋或箱蓋，並掛上標籤，標明蛇的種類和數目，便於查考有無失漏逃跑。
運輸中要注意通風、保溫（冬天要升溫、夏天要降溫），途中儘量減少停留時間，爭取儘早運達目的地。中途一般不需餵食，但需用水沖洗，較好用無污染的江河水沖洗。
在盛夏和嚴冬，長途運送活蛇比較困難，若買方只是需要食肉菜蛇，可就近聯系一個冷凍廠，冷凍後的蛇肉可以不受任何氣候條件限制，可長途運送甚至出口到歐美。凍蛇肉的規格是斬頭去尾，剝皮除內臟，按品種每紙箱7.5千克。餘下的頭、皮、油和內臟，可以綜合利用。
運輸中注意事項如下。
蛇袋用新布或用洗乾淨的麵粉袋做成，絕對不能用編織袋（蛇皮袋），否則蛇會鑽破編織袋逃走。長途運輸的車輛或船隻不能裝有損害蛇類健康的有毒化學物質或農藥等，否則蛇類會被毒死。