好的和田玉籽料，形狀，白度，皮色及潤度都是好才稱得上精品。歷來人們對和田玉的顏色非常重視，王逸《玉論》中載玉之色為：“赤如雞冠，黃如蒸栗，白如截脂，墨如純漆，謂之玉符。
玉有白、青、黑、赤、黃五色，而常見為青色、白色。付恒等纂《西域圖志》說，和闐玉河所出玉有：紺、黃，青，碧，白數色。椿園《西域聞見錄》說，葉爾羌所產之玉，各色不同，有白、黃、赤、黑、碧諸色。
以上說的是玉有五色，但是明代科學家宋應星卻認為玉只有白，綠兩色，他在《天工開物》中說：“凡玉唯有白與綠兩色，綠者中國名菜玉，其赤玉黃玉之說，皆其石琅類，價即不下玉，然非玉也。”古人對玉色說法不盡相同，經我們調查和闐玉實際上只有白、青、墨、黃四色。
另外，在昆侖山的某些地區和阿爾金山地區還產碧玉，也為軟玉，成因與超基性岩有關，如同加拿大碧玉和新疆瑪納斯碧玉相似，但也可以歸於和闐玉範圍。不同顏色的玉，質量也不盡相同，如《新疆格古要論・珍寶論》中說：“玉出西域於闐國，有五色……凡看器物白色為上，黃色碧玉亦貴。”中國自古以來，白色為純潔的象徵。《漢書・匡衡傳》：“顯潔白之士。”所以人們喜愛白色。白玉不僅顏色白，而且質地也好，深的人們寵愛，被列為珍品。
按和田玉中出現的顏色可分為五個色系：
1.白色系列：
在和田玉中白色玉也有不少品種：羊脂白；雪花白、梨花白、象牙白、魚肚白、糙米白、雞骨白等等。其中以細潤瑩潔的羊脂白最佳。在歷史上稱白玉之精、玉英、玉王。
2.綠色系列：
在青白玉、青玉中常呈淺綠白色、淡綠色、灰綠色，在碧玉中為綠色至暗綠色。從青白玉、青玉、碧玉依次排列，隨著顏色的加深，氧化鐵的含量有所增高，碧玉中普遍含鉻、鎳、鑽等超基性岩特有的元素。碧玉中組成礦物除透閃石外，開始出現陽起石或含鐵較多的透閃石。因而呈現不同色調、濃淡的綠色。黑斑和玉筋明顯。含少量雜質礦物。
3.黃色系列：
黃玉中有黃色、米黃色、蜜蠟黃、栗色黃、秋葵黃、葵花黃、雞蛋黃、半色黃、黃楊黃等，其中以栗色黃、蜜蠟黃者為上。其他黃次之。黃玉其色黃正而嬌，越濃亮越珍貴，其珍貴價值不在羊脂玉之下，且比羊脂玉還少見。多為含氧化鐵引起之色。
4.黑色系列：
和田玉中的墨玉（黑玉）有呈灰黑、黑色。黑色有時不均勻呈浸染狀、黑點狀、雲霧狀、純漆黑等色。優質者黑如純漆。因罕見而珍貴。墨玉又稱黑玉、或在黑玉中出現青玉、也有在青玉、白玉中出現墨玉。呈色原因主要由於在透閃石粒間存在有微鱗片狀石墨雜質所致。黑色的程度有强有弱，深淺分佈均有差別。
5.褐紅色系列及其他色：
和田玉中有因色似紅糖而稱糖玉。多呈紫紅色、褐紅色、血紅色（罕見）。在糖玉部位中的透閃石粒間分佈有褐鐵礦，說明糖玉是由於氧化鐵污染透閃石而形成紅色或褐黃色。含氧化錳可呈紫紅色。