細菌侵入的感染灶並不明顯，常不易找到，有時因檢查不全面而被漏查，特別被衣服遮蓋的部位如背部、骶尾部、四肢和腋下。
足月兒和晚期新生兒（生後2～4周）臨床症狀有發熱、拒食、神萎或煩躁不安，早產兒和低出生體重兒症狀不典型，表現為拒奶、溢奶、不哭、不動、面色蒼白、體重不增、體溫不穩、有時體溫不昇。
除上列症狀外，下列表現提示有敗血症可能。①黃疸加重或减退後又複現。有時黃疸可能是本症的主要表現。②肝脾輕度或中度腫大，無其他原因可解釋。③瘀點或瘀斑不能以新生兒紫癜或外傷解釋。
嚴重敗血症可出現中毒性腸麻痹，表現為腹脹，腸鳴音减低。或發生彌漫性血管內凝血、嘔血、便血，或肺出血。
歐美國家常見的B組溶血性鏈球菌（GBS）敗血症，我國也有報導。美國孕婦陰道和直腸GBS帶菌率高達20%～35%，出生的嬰兒生後3天內約有40%～75%帶同型細菌，但發病的僅1～2%。GBS敗血症分早發和晚發兩型，早髮型感染來自宮內或產時，GBSⅠa、Ⅰb、Ⅰc、ⅡⅢ各型都可能是病因。主要累及肺臟。嬰兒在生後0～4天發病，臨床表現和肺部X線片與新生兒肺透明膜病相似，甚至病理改變也相仿。晚髮型感染多來自醫護人員，90%由GBSⅢ型引起，起病多在出生5天后，約80%併發化膿性腦膜炎。